Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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