Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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