Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHPRHQ149N8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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