Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDCD11Q14690 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PDCD11Q14690 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms