Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCARB2Q14108 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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