Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXOSC2Q13868 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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