Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA9Q13797 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms