Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
APOFQ13790 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms