Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBA3CQ13748 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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