Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP1A4Q13733 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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