Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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