Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP3B2Q13367 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms