Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SKP2Q13309 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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SKP2Q13309 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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