Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RPA4Q13156 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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RPA4Q13156 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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RPA4Q13156 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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