Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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