Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms