Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRIK2Q13002 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK2Q13002 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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