Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSTF3Q12996 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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