Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TP53BP1Q12888 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms