Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TROQ12816 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TROQ12816 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TROQ12816 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TROQ12816 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TROQ12816 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TROQ12816 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TROQ12816 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TROQ12816 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TROQ12816 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TROQ12816 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TROQ12816 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TROQ12816 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TROQ12816 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TROQ12816 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TROQ12816 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TROQ12816 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TROQ12816 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
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