Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFFO1Q0D2I5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms