Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf54Q08AI8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms