Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDE4CQ08493 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms