Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DHX9Q08211 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms