Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CXCL9Q07325 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms