Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL16A1Q07092 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms