Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABPB1Q06547 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms