Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SSBP1Q04837 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP1Q04837 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms