Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLOD1Q02809 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms