Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MC1RQ01726 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms