Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PITX1P78337 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX1P78337 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX1P78337 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX1P78337 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX1P78337 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX1P78337 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX1P78337 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PITX1P78337 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms