Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RHOBP62745 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RHOBP62745 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RHOBP62745 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms