Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVFRD-1P60508 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms