Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSDMDP57764 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms