Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF3P57682 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms