Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIK1P57059 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIK1P57059 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIK1P57059 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIK1P57059 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms