Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLDN15P56746 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN15P56746 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms