Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms