Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBX2P52951 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GBX2P52951 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms