Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC3P51654 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC3P51654 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC3P51654 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC3P51654 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GPC3P51654 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GPC3P51654 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GPC3P51654 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPC3P51654 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPC3P51654 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms