Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RGS4P49798 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RGS4P49798 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RGS4P49798 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RGS4P49798 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RGS4P49798 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms