Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTBP49356 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTBP49356 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTBP49356 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTBP49356 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTBP49356 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNTBP49356 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTBP49356 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTBP49356 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms