Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHKA1P46020 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms