Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LRPPRCP42704 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRPPRCP42704 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms