Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASP3P42574 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASP3P42574 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASP3P42574 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASP3P42574 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASP3P42574 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms