Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARL1P40616 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL1P40616 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL1P40616 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL1P40616 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL1P40616 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARL1P40616 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARL1P40616 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms