Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARGP37231 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGP37231 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms