Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LTBRP36941 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LTBRP36941 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LTBRP36941 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LTBRP36941 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LTBRP36941 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms