Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPB2P35606 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPB2P35606 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPB2P35606 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPB2P35606 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPB2P35606 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPB2P35606 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPB2P35606 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPB2P35606 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
COPB2P35606 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
COPB2P35606 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPB2P35606 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPB2P35606 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPB2P35606 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COPB2P35606 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms