Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LSP1P33241 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LSP1P33241 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LSP1P33241 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LSP1P33241 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LSP1P33241 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
LSP1P33241 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms